Estancia pre-doctoral de formación en metagenómica en TEAGASC, Irlanda

Como parte de su formación pre-doctoral, Medelin Ocejo está realizando una estancia de 3 meses, financiada por el DDEI-Gobierno Vasco en el Instituto TEAGASC, en Cork (Irlanda). TEAGASC es un instituto de investigación perteneciente a la Autoridad Irlandesa de Agricultura y Alimentación, en el que se llevan a cabo actividades de investigación, asesoramiento y formación para el sector agroalimentario y el desarrollo rural. Durante estos meses trabajará bajo la supervisión del Dr. Paul Cotter, Investigador Principal de TEAGASC Food Research Centre además de jefe del Departamento Food Biosciences y responsable del servicio de secuenciación (DNA Next Generation Sequencing facility) de TEAGASC. Dr. Cotter, un experimentado microbiólogo molecular, centra su actividad investigadora en el área de la microbiología de los alimentos y en el estudio de la microbiota intestinal. Es a su vez profesor adjunto de la Universidad de Cork e investigador fundador del APC Microbiome Institute. El grupo del Dr. Cotter utiliza técnicas de análisis genómico de próxima generación para estudiar los microorganismos que colonizan el tracto gastrointestinal con el objetivo de obtener y mantener una flora sana a través de intervenciones en la dieta. En el departamento trabajan en varias áreas: compuestos bioactivos, biotecnología animal, salud gastrointestinal y nutraceúticos de la leche. Durante su estancia Medelin aprenderá a analizar e interpretar la información de secuencia de los metagenómas generada por secuenciación shotgun en el Proyecto CAMPYBIOTA (INIA RTA2013-00086-00-00) en el que se integra su trabajo de Tesis Doctoral dirigido por la Dra. Ana Hurtado y entre cuyos objetivos está el estudio del microbioma de las aves. Esta colaboración permitirá sentar las bases para una futura colaboración entre NEIKER y TEAGASC, instituciones homólogas en cuanto a su labor de proporcionar un servicio de investigación y asesoramiento al sector agroalimentario.

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